Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KLHDC4Q8TBB5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KLHDC4Q8TBB5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KLHDC4Q8TBB5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KLHDC4Q8TBB5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KLHDC4Q8TBB5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KLHDC4Q8TBB5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
KLHDC4Q8TBB5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KLHDC4Q8TBB5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
KLHDC4Q8TBB5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms