Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB73

NDNF, Protein NDNF, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNFQ8TB73 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDNFQ8TB73 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDNFQ8TB73 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNFQ8TB73 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms