Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEIL3Q8TAT5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEIL3Q8TAT5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL3Q8TAT5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms