Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GADD45GIP1Q8TAE8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GADD45GIP1Q8TAE8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GADD45GIP1Q8TAE8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GADD45GIP1Q8TAE8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GADD45GIP1Q8TAE8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GADD45GIP1Q8TAE8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45GIP1Q8TAE8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms