Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA1Q8NG27 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PJA1Q8NG27 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PJA1Q8NG27 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PJA1Q8NG27 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms