Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER1

TRPV1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV1Q8NER1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPV1Q8NER1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPV1Q8NER1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPV1Q8NER1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPV1Q8NER1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPV1Q8NER1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPV1Q8NER1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPV1Q8NER1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPV1Q8NER1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPV1Q8NER1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPV1Q8NER1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPV1Q8NER1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPV1Q8NER1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPV1Q8NER1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRPV1Q8NER1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPV1Q8NER1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPV1Q8NER1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPV1Q8NER1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPV1Q8NER1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRPV1Q8NER1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms