Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CARMIL3Q8ND23 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CARMIL3Q8ND23 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL3Q8ND23 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms