Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD12Q8N8I0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD12Q8N8I0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD12Q8N8I0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms