Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF148Q8N7C7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF148Q8N7C7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF148Q8N7C7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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