Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD6BQ8N6M0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD6BQ8N6M0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD6BQ8N6M0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD6BQ8N6M0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms