Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00337Q8N6G1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms