Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM199Q8N511 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM199Q8N511 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM199Q8N511 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM199Q8N511 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms