Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFRP1Q8N474 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFRP1Q8N474 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFRP1Q8N474 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFRP1Q8N474 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms