Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHTF2Q8N3S3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF2Q8N3S3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHTF2Q8N3S3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
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