Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C17orf53Q8N3J3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
C17orf53Q8N3J3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms