Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U9

PQLC1, PQ-loop repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1Q8N2U9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PQLC1Q8N2U9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PQLC1Q8N2U9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PQLC1Q8N2U9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PQLC1Q8N2U9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PQLC1Q8N2U9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PQLC1Q8N2U9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PQLC1Q8N2U9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PQLC1Q8N2U9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PQLC1Q8N2U9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PQLC1Q8N2U9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms