Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00528Q8N1L1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00528Q8N1L1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 782.7 ms