Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
GPC2Q8N158 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GPC2Q8N158 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GPC2Q8N158 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GPC2Q8N158 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPC2Q8N158 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms