Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT20Q8IY31 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT20Q8IY31 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT20Q8IY31 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms