Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALYREFQ86V81 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ALYREFQ86V81 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALYREFQ86V81 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms