Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
DHX29Q7Z478 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
DHX29Q7Z478 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DHX29Q7Z478 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DHX29Q7Z478 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DHX29Q7Z478 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms