Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC8DQ7L1W4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC8DQ7L1W4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC8DQ7L1W4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8DQ7L1W4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC8DQ7L1W4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC8DQ7L1W4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC8DQ7L1W4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC8DQ7L1W4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC8DQ7L1W4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC8DQ7L1W4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC8DQ7L1W4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC8DQ7L1W4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms