Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00336Q6ZUF6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms