Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL4Q6ZR62 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTL4Q6ZR62 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms