Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00114Q6XXX2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00114Q6XXX2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms