Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD1Q6UXZ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMIGD1Q6UXZ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms