Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HRCT1Q6UXD1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HRCT1Q6UXD1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HRCT1Q6UXD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms