Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL17Q6UXB2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL17Q6UXB2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL17Q6UXB2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL17Q6UXB2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL17Q6UXB2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CXCL17Q6UXB2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CXCL17Q6UXB2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL17Q6UXB2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL17Q6UXB2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL17Q6UXB2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL17Q6UXB2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CXCL17Q6UXB2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CXCL17Q6UXB2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CXCL17Q6UXB2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CXCL17Q6UXB2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms