Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSTM1Q6UX27 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSTM1Q6UX27 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VSTM1Q6UX27 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms