Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBSNQ6UWP8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBSNQ6UWP8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBSNQ6UWP8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBSNQ6UWP8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBSNQ6UWP8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBSNQ6UWP8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBSNQ6UWP8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBSNQ6UWP8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SBSNQ6UWP8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SBSNQ6UWP8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBSNQ6UWP8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBSNQ6UWP8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms