Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK4Q6UW60 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK4Q6UW60 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms