Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA2Q6UW10 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFTA2Q6UW10 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms