Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCD3Q6STE5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMARCD3Q6STE5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCD3Q6STE5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms