Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHC4Q6S5L8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHC4Q6S5L8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHC4Q6S5L8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHC4Q6S5L8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHC4Q6S5L8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHC4Q6S5L8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms