Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C22orf39Q6P5X5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C22orf39Q6P5X5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C22orf39Q6P5X5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C22orf39Q6P5X5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C22orf39Q6P5X5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms