Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMBOX1Q6NT76 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMBOX1Q6NT76 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms