Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SUMO4Q6EEV6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms