Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
USPL1Q5W0Q7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
USPL1Q5W0Q7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
USPL1Q5W0Q7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
USPL1Q5W0Q7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
USPL1Q5W0Q7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
USPL1Q5W0Q7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
USPL1Q5W0Q7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
USPL1Q5W0Q7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
USPL1Q5W0Q7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
USPL1Q5W0Q7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
USPL1Q5W0Q7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
USPL1Q5W0Q7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
USPL1Q5W0Q7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
USPL1Q5W0Q7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
USPL1Q5W0Q7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
USPL1Q5W0Q7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
USPL1Q5W0Q7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
USPL1Q5W0Q7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
USPL1Q5W0Q7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
USPL1Q5W0Q7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms