Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SFMBT2Q5VUG0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFMBT2Q5VUG0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 363.3 ms