Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
OBSCNQ5VST9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
OBSCNQ5VST9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms