Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIVEP3Q5T1R4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIVEP3Q5T1R4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIVEP3Q5T1R4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms