Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM240Q5SV17 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM240Q5SV17 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM240Q5SV17 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM240Q5SV17 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms