Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SAPCD1Q5SSQ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAPCD1Q5SSQ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAPCD1Q5SSQ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms