Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VAX1Q5SQQ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAX1Q5SQQ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms