Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPDYAQ5MJ70 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYAQ5MJ70 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms