Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCTE1Q5JU00 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCTE1Q5JU00 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCTE1Q5JU00 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTE1Q5JU00 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms