Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SBK1Q52WX2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBK1Q52WX2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SBK1Q52WX2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBK1Q52WX2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SBK1Q52WX2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms