Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP19-7Q3SYF9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP19-7Q3SYF9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms