Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00303Q3SY05 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00303Q3SY05 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms