Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDRF1Q3B7T1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDRF1Q3B7T1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EDRF1Q3B7T1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EDRF1Q3B7T1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDRF1Q3B7T1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDRF1Q3B7T1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDRF1Q3B7T1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDRF1Q3B7T1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDRF1Q3B7T1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDRF1Q3B7T1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDRF1Q3B7T1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDRF1Q3B7T1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDRF1Q3B7T1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDRF1Q3B7T1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDRF1Q3B7T1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms